儿童艾滋病的临床表现，除无淋巴结病变、卡波济氏肉瘤及机会性感染外，其他症状与成人患者相似。几乎所有艾滋病儿童均有肝脾肿大，间质性肺炎和发育差的表现。对记录艾滋病存活者资料的分析表明，艾滋病诊断中患者的临床表现和年龄都与存活率有关。

有50％的儿童在确诊后存活12个月，不足12月龄的卡氏肺囊虫肺炎患儿的一年存活率仅为30％；年长卡氏肺囊虫性肺炎患儿为48％；其他病情的年长儿为72％。这些发现在性质上与不同临床中心调查的结果相一致。

临床表现的特征出现在儿童组早期，通常在4～8月龄的儿童中出现包括卡氏肺囊虫肺炎、消瘦综合征和脑病等症状。在表现较早及较迟的儿童中都会出现从持续性中耳炎直至重型细菌性脑膜炎或肺炎。在机会性感染中儿童艾滋病患者与成人患者不同之处是儿童艾滋病患者细菌性感染十分多见，而卡波济氏肉瘤较成人少见。

实验室检查中大多数儿童艾滋病的淋巴细胞绝对数正常，这是区别于成人艾滋病的唯一免疫学指标。